Leçon 18 sur 49
Mutation et somation
Je sais distinguer une mutation, héréditaire car elle touche l'ADN, d'une somation, variation due au milieu et non transmise, et expliquer les différents types de mutations.
- 1 h
- 5 exercices corrigés
- 2 schémas
- QCM de 5 questions
À la fin de la leçon, tu sauras :
- Définir mutation et somation et savoir les distinguer par une expérience
- Décrire les mutations géniques (substitution, addition, délétion) et leurs conséquences sur la protéine
- Citer les mutations chromosomiques et les agents mutagènes
- Expliquer l'importance des mutations dans l'évolution et l'amélioration des espèces
Avant de commencer : L'ADN, le code génétique, la transcription et la traduction ; la génétique humaine (drépanocytose, trisomie 21).
1Je découvre
Dans un village de Moyenne-Guinée, Fatoumata cultive du maïs sur deux parcelles avec les mêmes semences, achetées au même sac. Sur la parcelle proche de la case, où elle met chaque année la fumure des animaux, les pieds sont hauts et les épis gros. Sur la parcelle du haut, un sol pauvre et caillouteux, les pieds sont petits et les épis maigres.
L'année suivante, elle sème sur la bonne parcelle des grains récoltés sur les pieds chétifs. Surprise : les nouveaux pieds sont aussi beaux que les autres.
Dans le même champ, son frère Alpha a remarqué un pied de maïs très différent : ses feuilles sont presque blanches. Les grains de ce pied, semés à part, donnent de nouveau des plantules sans chlorophylle.
Pourquoi certaines différences entre individus de même origine ne se transmettent-elles pas, alors que d'autres passent aux descendants ?
2Je comprends
1. Deux sortes de variations
Les individus d'une même espèce, et même d'une même famille, ne sont pas identiques. Les généticiens distinguent deux origines de ces variations.
- La somation (ou variation somatique, ou fluctuation) est une modification du phénotype provoquée par les conditions du milieu (sol, climat, nourriture, lumière, exercice). Elle ne touche pas les gènes : elle n'est pas héréditaire.
- La mutation est une modification brusque et héréditaire de l'information génétique, c'est-à-dire de l'ADN (un gène ou un chromosome). Elle se transmet aux descendants si elle touche les cellules reproductrices.
Autrement dit : phénotype = génotype + influence du milieu. La somation agit sur le phénotype seulement, la mutation agit sur le génotype.
2. Mettre en évidence une somation
Le botaniste danois Wilhelm Johannsen a étudié le haricot. Il a mesuré le poids des graines dans une lignée pure (des plantes toutes issues d'un même ancêtre par autofécondation, donc de même génotype). Les graines avaient des poids variés, répartis autour d'une moyenne. Il a semé séparément les plus lourdes et les plus légères de cette lignée : les deux descendances ont donné la même moyenne. Les différences observées étaient donc dues au milieu (place dans la gousse, nutrition), pas aux gènes.
Autres exemples :
- les plantes d'une même variété sont plus grandes sur un sol riche que sur un sol pauvre (les maïs de Fatoumata) ;
- le bronzage de la peau exposée au soleil ;
- les muscles développés par le travail ou le sport ;
- l'hortensia, qui donne des fleurs bleues sur un sol acide et roses sur un sol calcaire.
Exemple
Comment savoir si une variation est une somation ou une mutation ?
On place les descendants des individus « différents » et ceux des individus « normaux » dans les MÊMES conditions de milieu.
Si la différence disparaît chez les descendants : c'était une somation (non héréditaire).
Si la différence réapparaît chez les descendants : c'est une mutation (héréditaire).
Cas de Fatoumata : les grains des pieds chétifs, semés sur le bon sol, donnent des pieds normaux : somation.
Cas d'Alpha : les grains du pied blanc donnent de nouveau des plantules sans chlorophylle : mutation.
- Due au milieu
- Touche seulement le phénotype
- Non héréditaire
- Variations progressives autour d'une moyenne
- Réversible si le milieu change
- Due à une modification de l'ADN
- Touche le génotype
- Héréditaire (si elle touche les gamètes)
- Changement brusque et discontinu
- Stable, sauf nouvelle mutation (rare)
3. Les mutations géniques (ponctuelles)
Une mutation génique modifie la séquence des nucléotides d'un gène. Elle crée un nouvel allèle. On distingue trois types :
- Substitution : une base est remplacée par une autre. Exemple : la drépanocytose, où le codon GAG devient GTG dans le gène de la chaîne bêta de l'hémoglobine.
- Addition (insertion) : un ou plusieurs nucléotides sont ajoutés.
- Délétion : un ou plusieurs nucléotides sont supprimés.
Conséquences d'une substitution sur la protéine :
- mutation silencieuse : le nouveau codon code le même acide aminé (le code génétique est redondant) ; la protéine ne change pas ;
- mutation faux-sens : un acide aminé est remplacé par un autre ; la protéine peut perdre sa fonction ou fonctionner autrement (HbS) ;
- mutation non-sens : le codon devient un codon STOP (UAA, UAG, UGA) ; la protéine est raccourcie, souvent non fonctionnelle.
Une addition ou une délétion d'un nombre de nucléotides qui n'est pas multiple de 3 décale le cadre de lecture : tous les codons suivants sont changés, et la protéine est en général totalement anormale.
Méthode
Pour étudier les conséquences d'une mutation sur une protéine :
- J'aligne la séquence normale et la séquence mutée et je repère le nucléotide modifié et son type (substitution, addition, délétion).
- J'écris l'ARNm de chaque séquence (brin transcrit : A donne U, T donne A, G donne C, C donne G ; ou brin codant : je remplace T par U).
- Je découpe l'ARNm en codons à partir du codon initiateur AUG.
- Je traduis avec le tableau du code génétique.
- Je compare les deux chaînes d'acides aminés et je conclus : silencieuse, faux-sens, non-sens ou décalage.
Exemple
Brin codant d'un gène normal : ATG GAA TGG CTT...
Mutation 1 : ATG GAG TGG CTT... Mutation 2 : ATG GAA TGA CTT...
ARNm normal : AUG GAA UGG CUU → Met - Glu - Trp - Leu...
Mutation 1 : AUG GAG UGG CUU → Met - Glu - Trp - Leu...
GAA et GAG codent tous deux l'acide glutamique : mutation silencieuse, protéine inchangée.
Mutation 2 : AUG GAA UGA → Met - Glu - STOP.
UGG (Trp) devient UGA (STOP) : mutation non-sens, protéine réduite à deux acides aminés, non fonctionnelle.
Exemple
Délétion : brin codant normal ATG GCA TTC AAA... ; après délétion du C (5e nucléotide) : ATG GAT TCA AA...
ARNm normal : AUG GCA UUC AAA → Met - Ala - Phe - Lys.
ARNm muté : AUG GAU UCA AA... → Met - Asp - Ser - ...
Tous les codons après la délétion sont changés : décalage du cadre de lecture.
4. Les mutations chromosomiques
Elles touchent un chromosome entier ou un grand morceau, et sont souvent visibles sur le caryotype.
- Mutations de nombre : un chromosome en plus ou en moins (aneuploïdie : trisomie 21, syndrome de Turner) ou des lots entiers en plus (polyploïdie : 3n, 4n, fréquente chez les plantes cultivées, dont les fruits et les organes sont souvent plus gros).
- Mutations de structure : délétion d'un fragment, duplication, inversion (fragment retourné), translocation (fragment passé sur un autre chromosome).
5. Où, quand et pourquoi les mutations se produisent-elles ?
- Mutation spontanée : elle survient naturellement, surtout lors d'une erreur de réplication de l'ADN. Elle est rare et aléatoire : on ne peut pas prévoir quel gène sera touché.
- Mutation provoquée par des agents mutagènes : rayonnements (rayons X, rayons ultraviolets du soleil, radioactivité) et substances chimiques (certains produits de la fumée de tabac, certains pesticides mal utilisés, l'aflatoxine produite par des moisissures sur l'arachide ou le maïs mal conservés).
Mutation germinale ou somatique ?
- Si la mutation touche une cellule de la lignée germinale (qui donne les gamètes), elle peut être transmise aux enfants.
- Si elle touche une cellule somatique (peau, poumon…), elle n'est pas transmise aux enfants ; elle peut rester sans effet ou participer à l'apparition d'un cancer.
6. Le rôle des mutations
Les mutations sont la source de tous les allèles nouveaux, donc de la diversité génétique. La plupart sont neutres ou défavorables, quelques-unes sont favorables dans un milieu donné. Elles sont la matière première de l'évolution : la sélection naturelle trie les allèles selon leur effet sur la survie et la reproduction. L'être humain les utilise aussi pour améliorer les plantes cultivées et les animaux d'élevage, en sélectionnant les individus porteurs de mutations utiles.
- 1Agent mutagène (rayons UV, rayons X, produit chimique) ou erreur de réplication.
- 2Modification de la séquence de l'ADN : nouvel allèle.
- 3Modification éventuelle de l'ARNm puis de la protéine.
- 4Nouveau phénotype (parfois aucun changement visible).
- 5Transmission aux descendants si la mutation touche la lignée germinale.
3Je retiens
Je retiens
Somation : variation du phénotype due au milieu, non héréditaire.
Mutation : modification brusque, rare, aléatoire et héréditaire de l'ADN ; elle crée un nouvel allèle.
Test : placer les descendants dans le même milieu ; la différence persiste pour une mutation, disparaît pour une somation.
Mutations géniques : substitution (silencieuse, faux-sens, non-sens), addition et délétion (décalage du cadre de lecture).
Mutations chromosomiques : de nombre (trisomie, polyploïdie) ou de structure (délétion, duplication, inversion, translocation).
Agents mutagènes : rayonnements (UV, rayons X, radioactivité) et certaines substances chimiques.
Seules les mutations de la lignée germinale sont transmises aux enfants ; les mutations sont la source de la diversité génétique.
4Erreurs fréquentes
- Croire qu'un caractère acquis (muscles, bronzage) se transmet aux enfants : c'est une somation, les gènes ne sont pas changés.
- Penser qu'une mutation est toujours mauvaise : beaucoup sont neutres (mutations silencieuses) et certaines sont favorables.
- Dire qu'une mutation « apparaît pour s'adapter » au milieu : les mutations sont aléatoires ; c'est la sélection qui garde celles qui sont avantageuses.
- Oublier de découper l'ARNm à partir de AUG, ou oublier le décalage du cadre après une addition ou une délétion.
5Je m’exerce
1Exercice 1
(Questions de cours)
a) Définis mutation et somation.
b) Cite trois types de mutations géniques.
c) Une mutation dans une cellule de la peau d'un homme peut-elle être transmise à ses enfants ? Justifie.
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a) Mutation : modification brusque, héréditaire, de la séquence de l'ADN (d'un gène ou d'un chromosome). Somation : modification du phénotype provoquée par le milieu, sans changement des gènes, donc non héréditaire.
b) Substitution, addition (insertion), délétion.
c) Non. La mutation touche une cellule somatique ; les enfants sont issus des gamètes, formés par la lignée germinale, qui n'a pas été modifiée.
2Exercice 2
Classe chacune des variations suivantes en somation ou mutation, en justifiant :
a) un cheval de trait très musclé à force de travail ;
b) un chat albinos né de parents porteurs, dans une lignée où le caractère est apparu brusquement et se transmet ;
c) des plants de manioc plus petits dans un sol pauvre, qui donnent des boutures normales dans un bon sol.
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a) Somation : développement dû au travail (le milieu), non transmis aux poulains.
b) Mutation : apparition brusque d'un caractère qui se transmet.
c) Somation : placés dans un bon milieu, les descendants sont normaux ; la différence était due au sol.
3Exercice 3
Un fragment de brin codant normal est : ATG CCA GAA TGG. Utilise ces codons : AUG = Met ; CCA = Pro ; GAA = Glu ; GAG = Glu ; GUA = Val ; UGG = Trp ; UAG = STOP.
a) Écris l'ARNm et la chaîne d'acides aminés.
b) Mutation A : GAA devient GAG. Mutation B : GAA devient GTA. Mutation C : TGG devient TAG. Donne pour chaque mutation son type et sa conséquence.
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a) ARNm : AUG CCA GAA UGG. Chaîne : Met - Pro - Glu - Trp.
b) Mutation A : ARNm AUG CCA GAG UGG : Met - Pro - Glu - Trp. Substitution silencieuse : la protéine est inchangée (GAA et GAG codent Glu).
Mutation B : AUG CCA GUA UGG : Met - Pro - Val - Trp. Substitution faux-sens : Glu remplacé par Val ; la protéine peut être modifiée dans sa forme et sa fonction.
Mutation C : AUG CCA GAA UAG : Met - Pro - Glu - STOP. Substitution non-sens : la protéine est raccourcie et probablement non fonctionnelle.
4Exercice 4
On sème des graines issues des plus gros et des plus petits haricots d'une lignée pure, dans un même champ. Les deux descendances donnent des graines de même poids moyen.
a) Que peux-tu conclure ?
b) Que se passerait-il si la différence de taille était due à une mutation ?
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a) Dans une lignée pure, tous les individus ont le même génotype. Les différences de taille des graines étaient dues au milieu : c'est une somation, non héréditaire.
b) Si la différence était due à une mutation, elle serait héréditaire : les descendants des graines mutées garderaient une taille différente, même dans le même champ.
5Exercice 5
(Type BAC) L'hémoglobine normale et l'hémoglobine S diffèrent par un acide aminé. On donne le début du brin transcrit (non codant) du gène de la chaîne bêta, à partir du codon 5, pour les deux allèles :
- allèle A : 3'-GGA CTC CTC-5'
- allèle S : 3'-GGA CAC CTC-5'
Codons utiles : CCU = Pro ; GAG = Glu ; GUG = Val.
a) Écris les ARNm correspondants (sens 5' vers 3').
b) Traduis-les.
c) Nomme le type de mutation et explique comment elle provoque la maladie.
d) Pourquoi dit-on que cette mutation est héréditaire ?
Voir le corrigéCacher le corrigé
a) L'ARNm est complémentaire du brin transcrit et antiparallèle (C donne G, T donne A, G donne C, A donne U).
- Allèle A : brin transcrit 3'-GGA CTC CTC-5' ; ARNm 5'-CCU GAG GAG-3'.
- Allèle S : brin transcrit 3'-GGA CAC CTC-5' ; ARNm 5'-CCU GUG GAG-3'.
b) Allèle A : Pro - Glu - Glu (acides aminés 5, 6, 7). Allèle S : Pro - Val - Glu.
c) C'est une substitution (T remplacé par A sur le brin transcrit), de type faux-sens : l'acide glutamique du 6e acide aminé est remplacé par la valine. L'hémoglobine S ainsi formée s'assemble en fibres quand elle manque d'oxygène, les hématies prennent la forme de faucilles, bouchent les petits vaisseaux et sont détruites : c'est la drépanocytose.
d) Elle modifie la séquence de l'ADN d'un gène ; présente dans les cellules germinales des parents, elle passe dans les gamètes et donc aux enfants.
Cherche d’abord seul, sur ton cahier, puis ouvre le corrigé pour comparer.
6Je vérifie
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